在京都居住的內向男高中生直實，一直在看決斷力方面的書籍，但是在生活中他實在是用不出來那些方法。比如有的同學佔了他的座位，他只好默默走開，而不會努力爭取；比如餐廳打飯，他永遠是最後一個選擇的，先讓其他人選完……
原以為生活會一直這樣下去，直到他身邊出現了10年後穿越而來的他，電影中直實稱他為“老師”。老師說他不久會與同學一行琉璃相愛，三個月後琉璃因意外去世。他想再見一眼琉璃的音容笑貌，不惜與世界為敵，打算篡改了阿爾泰拉系統的記錄，企圖拯救女主。
直實覺得不可思議，畢竟在此之前他喜歡的是堪解由，一個性感可愛的女生，而不是琉璃這種個性獨立的女生。老師帶他來到河邊，他被一架無人機撞到，這件事情也被阿爾泰拉系統記錄了。直實不得不相信這個“老師”確實是十年後的自己。在老師的引導他，直實與琉璃感情發展順利，互相產生了愛意。直實在老師的指導下，戴上手套，擁有了“神之手”，可以創造武器、點石成金。後來直實靠不斷刻苦訓練，靠自己的本事拯救了琉璃，只是琉璃在床上躺了十年後才醒來。在這個過程中，一直有類似妖怪的系統防禦機制在阻止他們，企圖殺死不該存在於世界上的琉璃。
為了讓系統以為琉璃已經去世（它們只會刪除重複的內容，比如兩個直實要離世一個），十年後的直實果斷犧牲了自己，希望現在的直實可以帶琉璃過上幸福的生活。
後來，直實和琉璃經歷了種種磨難來到了一個新世界，兩個人終於可以幸福地在一起了。故事內容不長，但寓意深刻。在這個世界上其實還是有愛情存在的，只是人們面對重大事情或者抉擇的時候，容易一時自私，導致遺憾終身。即使有遺憾，我們也曾努力愛過，遺憾也是一種美，只要問心無愧就好。
