玄武門事變李世民一戰封帝后，跟著老闆的員工自然要一起發財，秦瓊分到了一個左武衛大將軍的官位，以及七百餘戶的封邑，直至最後秦瓊因病去世，李世民追贈其為徐州都督，翼國公，後來又改為胡國公。在凌煙閣功臣榜裡面秦瓊位列最後一位，排在熟知的尉遲敬德、程咬金等人後面。
實事求是，這些成績單的確讓人大失所望。左武衛大將軍的名號聽起來非常響亮，但是在唐代只是一個三品。而且從封邑上面來看，這個七百戶的待遇也沒有什麼價值，漢朝時代千戶以上的封邑比比皆是，甚至達到萬戶的也很常見。比如東漢的鄧禹就超過了一萬戶，而西漢的蕭何更是多達三萬戶，所以這種“萬戶侯”的待遇其實跟“王”也相差不大了。而在貞觀元年開始，一直活躍在戰場的猛將秦瓊似乎就像蒸發了一樣，直到去世的時候才被人想起，所以覺得這是被太宗李世民有意的打壓。
特別是凌煙閣排行榜末尾的待遇，確實讓很多人都不理解，覺得秦瓊一生征戰沙場，渾身上下四處是傷，可謂是一刀一槍給李唐王朝拼出來的天下。歷史記載：“所經二百餘陣，屢中重瘡，計吾前後出血亦數斛矣。”而且又在玄武門事變中支援李世民，這樣對待是不是顯得李世民太不講情義了？其實並不是這樣的。
首先橫向比較來看，太宗皇帝給予功臣的封邑不多，也基本都是在千戶左右。一代名將李勣也才900戶，秦瓊和程咬金、宇文士及的一樣，都是700戶。
從爵位來看，國公的爵位在唐朝僅次於王、郡王，幾乎也是異姓功臣裡面的最高爵位了，這個待遇其實並不低。從左武衛大將軍的職位來看，雖然說品級不高，但是這個位置非常的重要，負責守衛皇宮內外的安全，因此這個職位不是皇帝的親信是不可能任用來的。所以從這些事例分析來看，秦瓊無論在信任程度、待遇和職位方面都沒有受到輕視和打壓，完全的正常待遇。
其次是受到演義小說裡面的影響。很多人受到小說或者是演義裡面的影響，覺得秦瓊的歷史形象非常的高大上，自然也覺得他的歷史貢獻非常的大。
其實不然，那只是小說家虛構的藝術形象，在歷史上的秦瓊歷史功績遠遠沒有想象的那樣富有傳奇性。
秦瓊出身官宦家庭，祖父是北齊的武官，但是官職不高。秦瓊的仕途生涯的起點也很低，他開始的時候只是隋朝大將來護兒手下的一名普通士兵，後來又追隨名將張須陀和裴仁基，又隨著裴仁基一起投降瓦崗寨。邙山之戰李密被王世充收拾，秦瓊和程咬金等人被俘虜投降，王世充很欣賞秦瓊，封他為龍驤將軍，王世充雖然賞臉，但是秦瓊並不買賬，嫌王世充為人陰險狡詐，於是在戰場上和程咬金臨陣叛變投降了李世民，從此以後就一直追隨李世民。
秦瓊打仗的特點其實就是勇猛，身先士卒攻城拔寨他每次都衝鋒在前，兩軍對陣他敢衝敢戰，幾乎就是一把無堅不摧的利劍，所以身上才傷痕累累，李世民精選千餘人騎兵組建了一支野戰部隊，叫玄甲軍，秦瓊就是四個將領之一，用於戰場上撕開對方的防線，每戰必勝，令當時的對手聞風喪膽。
所以秦瓊真實的形象和演義小說中的不一樣，他並不是指揮千軍萬馬的統帥，只是一位戰場衝殺的勇將。
再說凌煙閣並非是按照功勞大小排名，而是以當時功臣們的最高官職排名，秦瓊大部分時間都是養病，很大程度上也影響了他後期的升遷。
最後就是玄武門事變中出力不大。秦瓊在玄武門事變中扮演了什麼角色，歷史的記載也不盡相同， 《舊唐書·秦瓊傳》記載：“六月四日，從誅建成、元吉。”而《新唐書》裡面的記載則是語焉不詳：“及平隱、巢，功拜左武衛大將軍。”
對比來看應該是說秦瓊參與了，但是和認真給李世民出謀劃策的房玄齡、杜如晦以及直接充當打手的尉遲恭、程咬金相比，可能貢獻就不太明顯，所以秦瓊在玄武門事變中應該不是李世民的核心骨幹成員。
而最後秦瓊淡出視野的原因是身體健康問題，隨著年齡的增長舊傷多復發，歷史記載的“其後每多疾病”就可以看出秦瓊的身體在貞觀年間幾乎都是請病假掛名上班的，所以不是被打壓，而是大部分時間都在養病。
