你的醜圖我看不下去了!GraphPad Prism 9.0自學大法,送你了!

點進來的各位,

你是否被統計作圖狠狠按在地上摩擦過?

反正小編真的是頭痛不已。

科研狗時間寶貴,真的沒那麼多時間去深度學習一個軟體。最常見的excel,學起來相當複雜,而且也很難做出好看的圖。

那麼有沒有什麼解決的辦法呢?

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GraphPad Prism 9.0

這款寶藏軟體來了!

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GraphPad Prism軟體最新版本為GraphPad Prism 9.0,其功能強大,簡單易學,能夠適合絕大部分醫學科研繪圖的實現。

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GraphPad Prism 9 核心新功能詳解

1. 更高維度的資料!

Prism 9對多變數資料表進行了許多重大改進。使用標準結構可以分析更大的資料集,並執行新的和改進的分析,主要改進如下:

提高了資料列的上限

- 在每個資料表中最多輸入1024列資料。

自動識別變數型別

- 將多變數資料表中的變數識別為連續值,分類值或標籤值。

資料表可輸入文字資訊

- 直接以文字形式輸入資料。無需將變數編碼“0”和“1”,只需直接在資料表中輸入例如“Male”和“Female”。

自動變數編碼

- 輸入您的資料,讓Prism負責其餘的工作。Prism會自動將分類文字變數編碼為數值型啞變數。

2. 主成分分析(PCA)

注:上圖以二維形式顯示了PCA的圖形示例。Prism中的PCA可以對數百個變數進行分析!

有時,收集的變數數量遠遠超過可供研究的受試者數量。看一下基因表達的研究,將受試者分為兩組:治療組和對照組,然後測量成百上千種不同基因的表達水平。可能只是變數太多而無法使模型適配資料。但是,簡單的去掉一些變數不去分析,可能會導致丟失有價值的資訊。選擇一些要從分析中排除的變數只會丟掉可能有用的資訊!PCA就是這樣一種“降低維度”的技術,可以用它來減少所需變數的數量,但同時從資料中消除儘可能少的資訊。

Prism 9的PCA還包括以下其他功能:

透過平行分析(以及Kaiser方法,總方差閾值方法等)來選擇成分。

生成碎石圖(Scree Plots)、分數圖(Score Plots)和雙標圖(Biplots)。

自動準備PCA的結果,以進一步用於多元線性迴歸(PCR - 主成分迴歸)。

3. 向圖表新增新的維度

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可以從原始資料 – 對符號位置(X和Y座標)、大小及填充顏色等編碼的變數,直接建立氣泡圖。請注意,可以使用分類(分組)變數或連續變數來定義符號顏色和大小。

在此圖上,有100多個國家/地區顯示為單個圓圈。每個圓圈的X座標代表該國的GDP(PPP),而Y座標代表出生時的平均預期壽命。每個符號的大小與其所代表的國家的人口成比例(兩個最大的符號分別代表中國和印度)。最後,每個符號的顏色代表該國家所在的大洲。在這個例子裡的變數(顏色)是分類變數,但氣泡圖中的顏色也可以像下面這樣由連續變數定義:

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此圖中,符號的X座標、Y座標和大小的定義與上例相同。但是,現在該符號的顏色是連續的,其代表該國家每1000個人的出生率。Prism現在還具有內建的半透明配色方案,以便可以更清晰地看到重疊的符號。

4. 自動將多個比較結果新增到圖形中

這就是你想要的!

對多個成對比較執行相應的分析後,點選一個按鈕就可以將這些結果自動新增到圖形中。要自定義這些線和星號,只需再次點選工具欄的按鈕即可。如果對資料或分析進行了調整,圖形上顯示的結果將自動更新。但是請記住,P值只是你研究成果的一方面。別忘了還要報告效應估計值(effect estimation,例如, 95%置信區間的均值差異!)。

5. 使用估計圖更好地視覺化T檢驗結果

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執行t檢驗時,Prism現在會自動建立分析結果的估計圖(Estimation Plots )。在此圖上,兩組的原始資料都將繪製在左側的Y軸上。在右邊的Y軸上,將繪製組均值差異及其95%置信區間。該圖比只使用P值會提供更多的資訊,因為它不僅顯示了95%CI是否包括零,還顯示了95%CI的範圍(如果95%CI包括零,則P值將大於0。05,如果95%CI不包含零,則P值將小於0。05)。

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網上有很多Graphpad Prism的教程,想自學的同學可以自行搜尋。不過這些教程有很多的問題,比如版本太老,或者講解不夠詳細等等。

考慮到很多同學沒有這麼多時間在網上整理資料,也就是懶癌晚期,為了方便大家學習,解螺旋順手為大家帶來了這本口碑超高的書籍教程,哪裡不懂,翻哪裡!

《GraphPad Prism學術圖表》

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書裡都有啥?

上下划動檢視

第1章介紹了

軟體下載、安裝、使用介面、圖形修飾與美化、學術圖表配色、圖片匯出和傳送等內容。

第2章介紹了

常見學術圖表分類及選擇與軟體內嵌的大部分統計方法。

第3章介紹了

XY表及該資料表型別所支援的12類圖表的繪製方法,以及帶統計分析的XY表圖形繪製,如相關分析、迴歸分析等。

第4章介紹了

縱列表(Column)及該資料表型別所支援的6類圖表的繪製方法,並基於例項介紹了包含t檢驗和方差分析的相關圖表繪製方法,以及ROC曲線、Bland-Altman圖的繪製。

第5章介紹了

行列分組表(Grouped)及該資料表型別所支援的5類圖表的繪製方法,並基於例項介紹了二(三)因素方差分析。

第6章介紹了

列聯表(Contingency)及該資料表型別所支援的圖表的繪製方法。

第7章介紹了

生存表(Survival)及該資料表型別所支援的生存曲線的繪製方法。

第8章介紹了

區域性整體表(Partsof whole)、多變量表(Multiplevariables)及巢狀表(Nested)這3種資料表及其所支援的圖形繪製,尤其是GraphPadPrism 9 新增的主成分分析和氣泡圖。

第9章介紹了

GraphPadPrism 繪圖進階技巧,包括首選項設定、圖形組合、自定義配色方案、魔棒工具、克隆和模板等內容。

書籍6大亮點如下:

1. 系統介紹Graphpad Prism 9使用方法,專業繪圖大戶了!

大家都知道,作為一款專業的資料處理和繪圖軟體,

GraphPad Prism 以其便捷性和專業性,在學術圖表繪製中具有重要地位。

但對比下來,目前在市面上系統介紹GraphPad Prism 繪圖的圖書難得一見,個別圖書也只是對該軟體較低版本的一些簡單功能進行了介紹。但,

本書主要介紹基於GraphPad Prism 9 的學術圖表繪製方法,可謂是贏在起跑線!

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2. 超過50種學術圖表的繪製方法,超全面了!

本書以軟體所定義的8 種資料表為綱,按照“資料錄入—資料分析—圖表生成與美化”的順序,結合科研例項,使用t 檢驗、方差分析、生存分析和主成分分析等相關統計分析方法,介紹了散點圖、氣泡圖、柱狀圖、線圖、餅圖、面積圖等常見學術圖表的繪製和美化方法。可謂一本書在手,從此可以繪製天下美圖!

3. 全面展現學術圖表的繪製和美化過程,可洗眼睛了!

這本書開篇就介紹了GraphPad Prism圖形生成和美化流程、學術圖表配色原則和技巧、常用學術圖表型別和軟體內嵌的大部分統計方法的選擇等內容,內容可謂細緻入理,環環相扣,重點是這個過程很洗眼睛,顏狗福利!

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4. 科研小白可“依葫蘆畫瓢”,太友好了!!!

本書適合於需要繪製學術圖表的高校學生和科研人員,也就是我,並且

不需要具有GraphPad Prism 使用基礎

只需要具備基本的計算機知識即可用本書

。因此,本書通常可以作為小白的工具書,可使我“依葫蘆畫瓢”地繪製所需要的學術圖表。但在涉及統計分析時,我需要結合自己的專業知識背景和統計學知識進行判斷。

(對小白太友好了,我打算給本書的作者寫封致謝信了!)

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5.

最後,就是本書還

提供59個繪圖原始檔下載哦

,這服務到位!

最後再次提醒大家,想要系統掌握科研繪圖,或者希望自己畫圖技能更加精湛的同學,快來參與解螺旋0元送書活動吧,一本書帶你修煉完整科研繪圖獨家秘籍”!

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