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原創 小薇 A科研顯微鏡
大家有沒有在做實時定量PCR的時候,不知道怎麼樣去選擇內參基因?或者在修回的時候,審稿人提出實驗所用內參基因不合適?那怎麼樣選擇合適的內參基因,你知道嗎?相信很多小夥伴對這個問題都比較迷糊,那今天小微就給大家介紹一個如何選擇內參基因的資料庫——
ICG資料庫(http://icg.big.ac.cn/index.php/Main_Page)
,它是北京基因組所在生命與健康大資料中心開發了國際上首個實時定量PCR內參基因知識庫,對經生物學實驗手段鑑定出的內參基因及其應用實驗實現了有效的挖掘、整合及註釋。
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首頁介紹了目前該資料庫排名前10的內參基因,以及所收錄的物種、內參基因、實驗處理條件等資訊
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該資料庫目前總共收錄了209個物種的內參基因,主要包括73種動物,115種植物,12種真菌以及9種細菌
(1)點選首頁“Species”即可查詢所有物種
(2)進入頁面可以直接點選感興趣的物種
(3)這裡每個物種資訊裡面包括物種的基本描述、內參適用的樣本型別、內參基因的資訊(包括基因名稱、應用範圍、accession號、引物序列、Tm溫度和qPCR型別等資訊)、內參基因的型別、評估方法以及相關參考文獻等。
比如這裡以“Rat”為例:
點選進入頁面會看到如下的目錄,主要包括“Rat”主要應用到哪些實驗中
更詳細的資訊可以直接往後翻,就能看到“Rat”應用到具體某個實驗中所用到的具體內參基因詳細資訊
利用這個資料庫,在選擇內參的時候,就可以參考一下,看看選擇哪些基因做內參會比較合適,你學會啦嘛?
歡迎小夥伴們關注小微,更多實用乾貨等你來拿 ~