父親有案底，離婚後孩子跟隨母親，父親的案底也會影響到孩子。
根據
《關於建立犯罪人員犯罪記錄制度的意見》的相關規定，
案底就是對犯罪人員的客觀記錄。案底會被錄入到犯罪資訊庫裡邊，孩子以後參軍，報考公務員，報考軍事院校，相關單位都會查直系親屬是否有犯罪記錄。
根據《中華人民共和國公務員法》第二十四條的規定，直系親屬有案底的，將會影響孩子的政審。截止2021年，我國招錄公務員、申請入黨、參軍、報考軍事院校都會進行政治核查；直系親屬三代以內，有犯罪記錄的，政審是通不過的。
無論父母離不離婚，無論孩子跟隨誰，法律上、血緣上就已經規定好了你們的關係，這個是改變不了的。只要你們存在直系關係，父親的案底就會影響到孩子以後的生活。
