水針刀治療點，又稱為靶點，是針刀療效的關鍵所在。水針刀微創針法根據人體生物力學、生物病理學原理；三點決定一個平面、三點決定一個三角區以及人體骨骼系統的穩定結構，依靠軟組織部分的肌腱、筋膜、韌帶固定，維繫人體骨骼框架的平衡穩定的原理，總結了一點三刀和三點三刀的治療點和水針刀微創針法。
根據以上原理，水針刀的治療點選擇主要從以下幾個部位：
⑴大都是軟組織損傷的結疤粘連點；無菌性炎症部位。這些部位靜態觸壓診有壓痛、酸脹、沉脹感；動診有陽性結節，有彈響，軟組織與骨端附著點或活動時的動痛點。
⑵肌肉肌腱的起始點、終止附著點、交會點、肌纖維起止處，為軟組織動態凝力點。
⑶肌肉筋膜受力點、牽拉點，如肩胛提肌終止受力點在C1～4橫突點及肩胛骨內上角。
⑷全身骨關節骨突點為受力點，如枕外隆突，顳乳突骨，上項線，下項線，脊柱三突，肩胛骨內上角、內下角、內緣、外緣，髂嵴，髂後上棘，大粗隆，骶骨胛，尾骨尖等這些點為動力損傷點，即動痛點。
⑸全身滑囊、關節囊分佈點，即靜態張力點，即靜痛點，如肩峰下滑囊，三角肌下滑囊，大粗隆滑囊，坐骨結節滑囊等，這些點為軟組織內壓增高點，即靜態張力點即為靜痛點。
