西奈山的研究人員發表了首批研究之一，將罹患COVID-19期間的血液基因表達變化與重症住院一年多後的患者的“Long-COVID”聯絡起來。長病程COVID是用於更專業地稱為SARS-CoV-2感染的急性後遺症的通用名稱。
12月8日發表在《自然醫學》（Nature Medicine）雜誌上的研究結果強調需要在感染階段給予更多關注，以更好地瞭解當時開始的過程如何最終導致長病程COVID，這可能有助於改善感染後出現持續症狀的COVID-19康復者的預防戰略和治療方案。
研究小組發現，除其他發現外，在急性COVID-19感染期間，漿細胞——免疫系統的抗體產生細胞——有兩個分子上不同的長病程COVID症狀子集，其基因表達模式是相反的。在繼續發展為肺部問題的患者中，抗體生產基因的含量較少。然而，對於有其他症狀的患者，如嗅覺或味覺喪失和睡眠障礙，同樣的抗體生產基因反而更加豐富。在同一細胞中觀察到的這些對立模式，以及在其他細胞型別中觀察到的其他獨特模式，表明存在導致不同長病程COVID症狀的多個獨立過程；這些過程在急性感染期間已經存在。
“我們的發現表明，導致長病程COVID的分子過程在COVID-19感染期間已經可以檢測到，”共同通訊作者、西奈山伊坎醫學院查爾斯-布朗夫曼個性化醫學研究所醫學（資料驅動和數字醫學）助理教授兼資料科學戰略副主任Noam D。 Beckmann博士說。“此外，我們看到了導致長病程COVID的多種分子不同路徑的開始，為了解長期症狀之間的差異提供了一個獨特的視角”。
利用西奈山COVID-19生物庫，研究人員檢查了2020年4月至6月間住院的500多名COVID-19患者的血樣中的基因表達資料。其中160多名患者提供了住院後六個月或更長時間內仍然存在的症狀的自我報告評估。該團隊測試了血液中表達的每個基因與每個長病程COVID症狀的關聯，考慮了ICU入院、住院期間COVID-19的嚴重程度、性別、年齡和其他變數。然後，研究小組測試了與13種不同型別的免疫細胞（包括漿細胞）中每一種的特定關聯。最後，這些關聯根據它們是否與患者的病毒特異性抗體水平的變化相匹配而進行分類。
“對於長病程COVID症狀，如嗅覺或味覺問題，將漿細胞中的抗體基因表達與針對SARS-CoV-2尖峰蛋白的實際抗體水平聯絡起來，表明與身體對病毒的反應有直接聯絡，”領銜作者、查爾斯-布朗夫曼個性化醫學研究所的資料科學分析師Ryan C。 Thompson博士說。“另一方面，肺部問題的基因表達模式與SARS-CoV-2特異性抗體水平不匹配，突出了導致長病程COVID的不同免疫過程是由COVID-19引發的”。
該團隊說，長病程COVID仍然定義不清，未來的研究應考慮到感染的初始階段，以更全面地描述長病程COVID的分子過程，並確定可以幫助預測、治療和預防延長症狀的生物標誌物。
“我們的研究結果顯示，有可能利用感染階段的資料來預測患者幾個月後可能發生的情況，”共同通訊作者、遺傳學和基因組科學副教授、查爾斯-布朗夫曼個性化醫學研究所共同主任Alexander W。 Charney博士說。“我們在研究長病程COVID時不應忽視感染階段——這顯然是一個關鍵的時間視窗，身體對SARS-CoV-2的反應可能為即將發生的事情奠定基礎”。
