黃巾軍既平，漢靈帝大赦天下，改年號為中平。
張角為首的黃巾軍主力被鎮壓，標誌著黃巾起義失敗。
這場轟轟烈烈的起義，經過十餘年的精心準備，卻短短九個月就宣告失敗。
之後，黃巾餘部和各地的農民武裝，仍然堅持鬥爭。
起義軍的稱號也各自不同，千奇百怪，但很接地氣，基本都是根據為首將領特徵而來。
如說話聲音大的就自稱雷公，騎白馬的就叫張白騎，行動輕便的就說是飛燕，鬍鬚多的就號稱於氐根，大眼的就說大目，嘴巴大的就是大嘴，等等。
中平二年（185）二月，朝廷日益腐敗，百姓不堪重負，自黃巾起義後，西及益州（今四川、貴州和雲南北部），南至交趾（今廣東、廣西一帶），北至幽州（今河北、遼寧一帶），各地義軍紛紛起事。
張牛角、褚飛燕、黃龍、左校、於氐根、張白騎、劉石、左髭文八、平漢大計、司隸緣城、雷公、浮雲、白雀、楊鳳、於毒、五鹿、李大目，白繞、眭固、苦蝤等等，簡直舉不勝舉。
這些隊伍大的有二三萬人，小的有六七千人，青州黃巾軍更是超過百萬，黑山軍也有百萬部眾。
義軍攻城掠縣，誅殺官吏，聲勢浩大，此起彼伏，形成燎原之勢。
博陵（今河北蠡縣）人張牛角，趁黃巾起義之機聚眾起義，自稱將軍，與真定（今河北正定南）人褚燕合兵一處。
大家共推張牛角為首領，進兵攻打癭陶（今河北寧晉縣）。
張牛角被流箭射中，身受重傷，臨死之前，命令部下尊奉褚燕為首領。
褚燕身輕如燕，驍勇善戰，有個外號叫“飛燕”。
為了紀念張牛角，褚飛燕改姓張，喚作張燕。
當時的黃巾軍以青徐部、褚燕和張牛角部規模最大，張牛角手下就有五十餘萬兵馬。
這些義軍活動在中山、常山、趙郡、上黨、河內等地太行山脈之中，山脈南端有座山叫黑山，改名後的張燕眼看黃巾軍氣數已近，就將自己的隊伍改名黑山軍，黑山地區其他義軍紛紛來投，達到百萬之眾，又稱“黑山賊”，不斷侵擾黃河以北各郡縣，東漢朝廷無力圍剿。
各州郡官員為了鎮壓黃巾軍，招兵買馬，擁兵自重，漸漸地不聽朝廷號令，實力強大的，甚至明目張膽打起了郡縣的主意，與盜賊無異。
張燕關注局勢發展，覺得還是官方的外衣名正言順，於是派使者到京師洛陽，上書朝廷，請求歸降。
漢靈帝劉宏任命張燕為平難中郎將，負責管理黃河以北山區的行政及治安事務，每年可以向朝廷推薦孝廉，派遣計吏到洛陽去彙報，相當於太守之職。
中平五年（188年），黃巾餘部郭大等在白波谷（今山西襄汾）聚眾起義，攻打太原（治今山西太原）、河東（治今山西夏縣西北）等郡。
四月，汝南郡（治今河南平輿北）葛陂（古湖泊名，在今河南新蔡北）黃巾軍再起，攻沒郡縣。
十月，青州（治今山東淄博）、徐州（治今山東郯城）黃巾軍又起，攻略郡縣。
十一月，東漢朝廷派下軍校尉鮑鴻進討聲勢最大的葛陂黃巾。
雙方大戰於葛陂，鮑鴻軍敗，次年二月以征戰無功下獄死。
黃巾各部此伏彼起，聲勢復盛。
中平五年（188），巴郡（今重慶北嘉陵江北岸）黃巾軍起，巴郡板楯蠻乘勢再起，攻打郡縣，抄略城邑。
東漢朝廷派遣西園上軍別部司馬趙瑾率軍進討，隨即將板楯蠻平定。
同年，益州馬相、趙祗等在綿竹（今四川綿竹東南）領導農民起義，也自號黃巾，旬月之間，攻破廣漢、巴郡、犍為數郡，殺益州刺史郗儉，隊伍發展到十餘萬人。
馬相自稱“天子”，後被益州從事賈龍所破。
青州黃巾一度發展到擁眾百萬，戰鬥力也很強，長期在青、徐、兗、冀四州流動作戰，給當地的封建割據勢力和豪強地主以沉重的打擊。
青州黃巾軍後來雖被迫接受曹操的收編，但徐和、司馬俱和管承領導的黃巾軍仍分別在濟南、樂安、長廣等地活動，一直堅持到建安十二年（207年），還攻殺了濟南王劉贇。
黃巾起義以及在它影響下的各族人民起義，從漢靈帝中平元年（184年）到漢獻帝建安中葉（207年），持續進行了二十多年的英勇鬥爭，給東漢王朝以沉重打擊。
