《倚天屠龍記之九陽神功》有兩個細節令人費解：
第一，小昭為何要吃蜘蛛，還騙張無忌說吃糖？
光明頂密室裡面有一隻蜘蛛掉在張無忌身上，小昭既沒提醒張無忌，也沒自己動手拍掉，而是抓了放嘴裡吃掉了，這點很令人費解，好端端地吃什麼蜘蛛？
這一版本少了兩個比較重要的人物：一個是楊逍的女兒楊不悔，另外一個就是修煉千蛛萬毒手的殷離，從周芷若是滅絕師太徒弟（很可能就是紀曉芙）的女兒來看，很顯然周芷若和楊不悔是合二為一了，那麼這個細節是不是暗示小昭和殷離也同樣是合二為一了，不知道即將開播的《倚天屠龍記之聖火雄風》會不會對此有所交代。
第二，張無忌已練成九陽神功，為何驅除玄冥寒毒卻用乾坤大挪移的功法？
張三丰以九陽神功驅毒，張無忌在冰火島修煉九陽神功16年，功力比張三丰更勝一籌，和玄冥二老交手中了一掌之後輕描淡寫就以九陽神功化解了玄冥寒毒，可是後面她為小昭以及楊逍和韋一笑三人驅毒用的卻是乾坤大挪移，而且是把寒毒轉移到別人身上才行，為小昭驅毒居然轉移到了陽頂天的屍骨上有點說不過去吧？
無論是原著還是眾多倚天版本，九陽神功都是玄冥寒毒的剋星，從沒聽說過還能用乾坤大挪移來驅毒，長見識的同時也讓人費解。
新版本對原著的改動有點大，比如成昆成了謝遜的師兄，出賣張無忌行蹤的是紀曉芙，張翠山和殷素素沒有自殺，張無忌居然是偷拿了武當秘籍到了冰火島才修煉成功九陽神功等等。
