這兩項技術現在市面上都有在用，不能說誰比誰更好，只是技術側重點不同。
就噴射設定特點來說，多點電噴是指噴射器安裝在每個氣缸的進氣管上，每個氣缸都會設計有一個噴射點。這種設定帶來的直接好處是可以採用順序噴射，空燃比的控制能更加精確，對降低排放有利。
不過它仍然是在進氣歧管上進行噴油，就節油性角度看，沒有缸內直噴直接。為什麼這麼說，顧名思義，缸內直噴是指將燃油直接噴入缸內與進氣混合燃燒。這項技術有著可以實現高壓縮比，提高功率與扭矩的優點。
另外，缸內直噴發動機的混合氣濃度比多點電噴發動機的要低，更高空燃比下的稀薄燃燒在做同樣多的功時，自然能獲得更低的油耗。不過缸內直噴並不是完美的技術，因為在提到了燃燒效率的同時，不可避免地會增加積碳和汙染物排放。
這是因為缸內直噴不能像進氣歧管噴射一樣透過汽油對氣門背部進行沖刷，導致發動機的自清潔的能力降低，容易引發積碳。
除此外，因為缸內直噴技術空燃比偏離理想空燃比，在低負荷工況下，氣缸內的進氣量不飽滿，導致混合氣偏濃，會產生大量的NOx與高溫，會加大三元催化器的負擔。
除以上外，相比於多點電噴，缸內直噴的難點更多。比如工況變化時負荷平滑過渡所要求的噴射策略較為複雜；高壓供油系統零件的磨損較快；對燃油質量要求高、氣缸頂設計和製造的要求高等。
