大約4600年前，炎帝王朝衰落，蚩尤部與黃帝部先後分離出來，於是就形成了上古版三國演義，即炎帝部、蚩尤部、黃帝部爭霸。最終，黃帝先後擊敗炎帝與蚩尤，成為當時部落聯盟盟主。此後2600年內，華夏一直由黃帝家族主宰，顓頊、帝嚳、帝舜、大禹、商契（商代始祖）、周后稷（周代始祖）都是黃帝后代。其中，司馬遷筆下的五帝與大禹家世如下：
黃帝—玄囂—喬極—帝嚳—堯
黃帝—昌意—顓頊—窮蟬—敬康—句望—橋牛—瞽叟—舜
黃帝—昌意—顓頊— 鯀 —禹
根據《五帝本紀》記載，顓頊是黃帝之孫，帝嚳是黃帝曾孫，帝堯是帝嚳之子，帝舜是黃帝八世孫，大禹是顓頊之孫、黃帝的四世孫，商契與周后稷是帝嚳之子。所謂世孫，即是後代之意，比如黃帝之子玄囂是第一代世孫，帝堯是第四代世孫。
問題在於：舜是黃帝八世孫，禹是黃帝四世孫，大禹輩分遠高於帝舜，但帝舜卻是大禹之前的帝王，這就顯得非常不符合邏輯，那麼這是為什麼？司馬遷又是如何看待的？
根據《史記》記載，舜50歲時攝政，58歲時繼位，守喪三年後61歲時正式繼位，在位39年，100歲去世，將王位禪讓給了大禹。大禹守喪三年後，將王位讓給帝舜兒子商均，但諸侯卻主動朝拜大禹，於是大禹順應天意正式繼位。
其中，帝堯期間，舜攝政時，先後殺了鯀，以及任命大禹治水。因此，假設大禹治水時是20歲，他治水時低於這個年齡的可能性不大，那麼大禹繼位時至少62歲，在位十年，死時至少72歲。而如果大禹治水時，年齡與舜大致相同，或者比舜高的話，那麼最終大禹壽命將不符合人類年齡極限。言而總之，按照人類正常壽命計算，帝舜比大禹年齡估計要大20歲左右。
帝舜與大禹這兩支，前三代都是“黃帝、昌意、顓頊”，只有第四代時出現分化，顓頊之子窮蟬的五世孫是帝舜，顓頊之子鯀的兒子是大禹。因此，如果要符合邏輯的話，鯀壽命必然要很大很大，帝舜之前的四代人壽命必然要很小很小，否則時間上將出現重大漏洞。
但實際上，帝舜親自下令處死治水不力的“鯀”，導致大禹治水時“三過家門而不敢入”。也就是說，鯀的年齡即便比舜大，估計也大的有限。
黃帝三世孫“鯀”的年齡，與黃帝八世孫“舜”的年齡差不多，而他們這二支的前兩代完全相同，那麼基本可以斷定，司馬遷筆下的帝舜與大禹家世有問題，即要麼大禹世家不可信，要麼他們源於黃帝之說不可信。
當然，這裡不是說司馬遷故意編造歷史，而是史料來源可能就有問題，比如《禮記》等中曾經提到：“有虞氏禘黃帝而郊嚳，祖顓頊而宗堯。夏后氏亦禘黃帝而郊鯀，祖顓頊而宗禹。殷人禘嚳而郊冥，祖契而宗湯。周人禘嚳而郊稷，祖文王而宗武王。”舜和禹將黃帝視為祖宗，商和周將帝嚳視為祖宗，而帝嚳又是黃帝后代，因此司馬遷編制的黃帝譜系是有根據的。
需要注意的是，上文談到的“郊冥”、“郊嚳”等，其實就是在野外祭祀祖先。很多農村人都知道，清明節時，對於一些久遠的先人，一般在室外燒紙祭祀；而在室內隆重祭祀的，一般是較近的祖先，或者說是始祖人物。
但司馬遷在編制黃帝譜系時，又的確有著自己的加工，《史書》記載得很清楚。
早在編寫《史記》時，司馬遷的朋友張夫子質疑說：“詩言契、后稷皆無父而生。今案諸傳記鹹言有父，父皆黃帝子也，得無與詩謬秋？”因為《詩經》中說商契、周后稷都不知父親是誰，但司馬遷都把他們說成黃帝后代，所以張夫子質疑司馬遷的加工。
司馬遷辯解稱：“天命難言，非聖人莫能見。舜、禹、契、后稷皆黃帝子孫也。黃帝策天命而治天下，德澤深後世，故其子孫皆復立為天子，是天之報有德也。人不知，以為泛從布衣匹夫起耳。夫布衣匹夫安能無故而起王天下乎？其有天命然。”
透過司馬遷的辯解可見，他既有“天下有德者居之”的思想，又有強烈的血統思想，認為黃帝功德無量，後世上天為了報德，會讓黃帝后代成為天子，而真正的布衣不可能無緣無故地成為天子，顓頊、帝嚳、帝舜、大禹等成為天子，必然是擁有大功德的黃帝后代。
由此可見，帝舜、大禹是不是黃帝后代，其實並無實據，而是司馬遷等古代學者的推斷。而如果帝舜與大禹不是黃帝后代，帝舜只是比大禹早的一位帝王罷了，那麼帝舜與大禹自然也就沒有因黃帝譜系而帶來的邏輯問題。
不過，黃帝與顓頊、帝嚳、帝舜、大禹等人，可能不是沒有關係，只是或許沒有血緣關係，但卻可能是政治祖先，即黃帝是“君父”。
帝嚳與元妃生下週后稷，與次妃生下商契，即商周王朝都是帝嚳後代建立的。但這種可能性很小，真相應該是：商朝時，周人臣服於殷商，自然要奉商人始祖為祖，因此當時周人的說法應該是“帝嚳與元妃生下商契，與次妃生下週后稷”；周朝時，為了減少殷商影響力，為周人奪取江山尋找合法性，於是改為“帝嚳與元妃生下週后稷，與次妃生下商契”。其中，帝嚳實際上與周人可能沒有血緣關係，但卻肯定是周人的“政治祖先”。
《清華簡·五紀》記載：“黃帝有子曰蚩尤，蚩尤既長成人，乃作為五兵。”這裡面將黃帝與蚩尤說成父子關係，顛覆了無數人的認知，但仔細思考不難發現，這裡面說的應該是“君父”關係，成王敗寇，如果蚩尤獲勝的話，可能會寫成“蚩尤是黃帝之父”。
因此，由於戰國以來推崇黃帝，導致黃帝影響力非常大，或許由此慢慢成為了其他帝王的“政治祖先”，就比如後世王朝無比怎麼更迭，都會視自己為上天之子，而“天”就是所有帝王的“政治君父”。
也就是說，黃帝應該不是顓頊、帝嚳、帝舜、大禹等所有人的血緣祖先，而是他們的政治祖先。只是司馬遷在描述這段上古史時，採用線性敘述的方式，強行將上古幾個著名帝王串聯起來，並給予他們與黃帝血緣關係，由此導致帝舜與大禹出現了違背邏輯的關係。而實際真相應該是，黃帝是黃帝，帝舜是帝舜，大禹是大禹，彼此沒有什麼血緣關係。
參考資料：《史記》等
